1. Gedung Sekolah
2. Ruang Belajar
3. LMS
MTs Negeri 3 Jakarta Selatan sejak tahun pelajaran 2019/2020 menerapkan blanded learningmenggunakan Learning Management System berbasis schoology, berkenaan dengan hal tersebut madrasah telah menyediakan fasilitas berupa: internet dedicated menggunakan provider icon plus, server yang memadai, serta pemasangan acces point di seluruh ruang kelas dan ruang lab.
4. Lapangan
5. Ruang Multimedia
6. Ruang TIK
7. Lab Bahasa
8. UKS
9. Perpustakaan
10. Kantin
11. Kamar Mandi Siswa
12. Kendaraan Operasional Sekolah